生物芯片,又稱蛋白芯片或基因芯片,它們起源于DNA雜交探針技術(shù)與半導(dǎo)體工業(yè)技術(shù)相結(jié)合的結(jié)晶。該技術(shù)系指將大量探針分子固定于支持物上后與帶熒光標(biāo)記的DNA或其他樣品分子(例如蛋白,因子或小分子)進(jìn)行雜交,通過檢測每個(gè)探針分子的雜交信號強(qiáng)度進(jìn)而獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。
生物芯片(biochip或bioarray)是根據(jù)生物分子間特異相互作用的原理,將生化分析過程集成于芯片表面,從而實(shí)現(xiàn)對DNA、RNA、多肽、蛋白質(zhì)以及其他生物成分的高通量快速檢測。狹義的生物芯片概念是指通過不同方法將生物分子(寡核苷酸、cDNA、genomic DNA、多肽、抗體、抗原等)固著于硅片、玻璃片(珠)、塑料片(珠)、凝膠、尼龍膜等固相遞質(zhì)上形成的生物分子點(diǎn)陣。因此生物芯片技術(shù)又稱微陳列(microarray)技術(shù),含有大量生物信息的固相基質(zhì)稱為微陣列,又稱生物芯片。生物芯片在此類芯片的基礎(chǔ)上又發(fā)展出微流體芯片(microfluidics chip),亦稱微電子芯片(microelectronic chip),也就是縮微實(shí)驗(yàn)室芯片。
芯片的概念取之于集成的概念,如電子芯片的意思就是把大的東西變成小的東西,集成在一起。生物芯片也是集成,不過是生物材料的集成。像實(shí)驗(yàn)室檢測一樣,在生物芯片上檢查血糖、蛋白、酶活性等,是基于同樣的生物反應(yīng)原理。所以生物芯片就是一個(gè)載體平臺。這個(gè)平臺的材料則有很多種,如硅,玻璃,膜(纖維素膜)等,還有一些三維結(jié)構(gòu)的多聚體,平臺上則密密麻麻地?cái)[滿了各種生物材料。芯片只是一個(gè)載體。做什么東西、檢測什么,還是靠生物學(xué)家來完成。也就是說,原來要在很大的實(shí)驗(yàn)室中需要很多個(gè)試管的反應(yīng),現(xiàn)在被移至一張芯片上同時(shí)發(fā)生了。
生物芯片制備方法
包括原位合成和預(yù)合成后點(diǎn)樣。
原位合成:適用于寡核苷酸,通過光引導(dǎo)蝕刻技術(shù)。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等基因突變的基因芯片。
預(yù)合成后點(diǎn)樣:是將提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、基因組DAN等通過特定的高速點(diǎn)樣機(jī)器人直接點(diǎn)在芯片上。該技術(shù)優(yōu)點(diǎn)在于相對簡易低*,被國內(nèi)外廣泛使用。
接觸式點(diǎn)樣:是指打印針從多孔板取出樣品后直接打印在芯片上。打印時(shí)針頭與芯片接觸。優(yōu)點(diǎn)是探針密度高,通常一平方厘米可打印2500個(gè)探針。缺點(diǎn)是定量準(zhǔn)確性及重現(xiàn)性不太好。
非接觸式點(diǎn)樣:針頭與芯片保持一定距離。優(yōu)點(diǎn)是定量準(zhǔn)確重現(xiàn)性好,缺點(diǎn)是噴印的斑點(diǎn)大,密度低。通常一平方厘米只有400點(diǎn)。但是**公司能把噴印點(diǎn)直徑大小由150-100μm降到30-25μm。可將哺乳動(dòng)物整個(gè)基因組DNA點(diǎn)陣于一張芯片上成為可能。